宮沢賢治も訪れた地層の大路頭「ようばけ」の近くに建てられています。この地層からは、クジラやサメ、カニ、貝類などの貴重な化石が数多く発見されています。化石館では、これらの化石を展示しているほか、ようばけの説明などもあります。化石の学習・研究にご利用ください。